Elérhető a HTC Flyer számára kiadott új frissítés, mely legfőbb célja a készülék sebességének és stabilitásának fokozása. A 25 MB méretű javítócsomag a menürendszerben és az előre telepített alkalmazásokban nem okoz látható voltozásokat, de a felhasználói visszajelzések szerint a 2.000.405.3 verziójú szoftver a készülék működését sokkal gördülékenyebbé teszi. Az új firmware telepítése előtt ajánlatos biztonsági mentést készíteni, valamint az adatvesztés elkerülése érdekében a frissítési folyamat megkezdése csak teljesen feltöltött akkumulátor esetén javasolt.