A Sony korábbi bejelentésének megfelelően az Xperia Z1 és Z Ultra számára is elérhetővé vált az Android 4.2 rendszerfrissítés, mely az operációs rendszer hatékonyabb energiakezelése és optimizálása révén gyorsabb működést és hosszabb üzemidőt ígér. Az Xperia Z1 kameraszoftvere már korábban ráncfelvarrást kapott, ám most a Smart Social Camera platform is alaposan átdolgozásra került, mely elsősorban a Burst Mode, Superior Auto, AR Effect és Sweep Panorama üzemmódokban biztosít sokkal gördülékenyebb használatot. A képalkotás megregulázása, a megjelenítő vezérlője is átkalibrálásra került, mely révén az ujjak, ceruzák, fém tollak érintését is sokkal pontosabban érzékeli. A számos optimizálás mellett természetesen további hibajavításokat is tartalmaz az új firmware, melyek közül az Exchange elérés akadozásai is javításra kerültek.